RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509870.1

HOXC-AS3-201, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 544 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37.3■■■■□ 3.56
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.28■■■□□ 2.92
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC9O60706 1549 aa33■■■□□ 2.87
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.58■■■□□ 2.65
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NACADO15069 1562 aa31.47■■■□□ 2.63
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.42■■■□□ 2.62
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.18■■■□□ 2.58
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP30.95■■■□□ 2.55
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.82■■■□□ 2.52
HOXC-AS3-201ENST00000509870 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.71■■■□□ 2.51
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.58■■■□□ 2.49
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SCRIBQ14160 1630 aa30.32■■■□□ 2.44
HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.81■■■□□ 2.36
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.73■■■□□ 2.35
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NCAPD3P42695 1498 aa29.07■■■□□ 2.24
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.99■■■□□ 2.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMARCA4P51532 1647 aa28.98■■■□□ 2.23
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SMARCA2P51531 1590 aa28.93■■■□□ 2.22
HOXC-AS3-201ENST00000509870 HMGXB3Q12766 1538 aa28.83■■■□□ 2.21
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PEG3Q9GZU2 1588 aa28.74■■■□□ 2.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP28.72■■■□□ 2.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MROH2BQ7Z745 1585 aa28.71■■■□□ 2.19
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERCC6Q03468 1493 aa28.52■■■□□ 2.16
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NESP48681 1621 aa28.42■■■□□ 2.14
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CUX2O14529 1486 aa28.37■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WIZO95785 1651 aa28.33■■■□□ 2.13
HOXC-AS3-201ENST00000509870 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.32■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.22■■■□□ 2.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.21■■■□□ 2.11
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa28.05■■■□□ 2.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.99■■■□□ 2.07
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CFTRP13569 1480 aa27.93■■■□□ 2.06
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.89■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.84■■■□□ 2.05
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR62O43379 1518 aa27.78■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CCDC88BA6NC98 1476 aa27.76■■■□□ 2.04
HOXC-AS3-201ENST00000509870 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.56■■■□□ 2
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRDM2Q13029 1718 aa27.53■■■□□ 2
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCC8Q09428 1581 aa27.39■■□□□ 1.97
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOPBP1Q92547 1522 aa27.34■■□□□ 1.97
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IFT140Q96RY7 1462 aa27.31■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.29■■□□□ 1.96
HOXC-AS3-201ENST00000509870 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.25■■□□□ 1.95
HOXC-AS3-201ENST00000509870 OSCARQ8IYS5 282 aa27.21■■□□□ 1.95
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
HOXC-AS3-201ENST00000509870 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.07■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SOGA1O94964 1423 aa27.01■■□□□ 1.91
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HOXC-AS3-201ENST00000509870 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.96■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CUX1P39880 1505 aa26.95■■□□□ 1.91
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.94■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRIM41Q8WV44 630 aa26.89■■□□□ 1.9
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WDR97A6NE52 1622 aa26.83■■□□□ 1.89
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FBLN2P98095 1184 aa26.81■■□□□ 1.88
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRIN2BQ13224 1484 aa26.73■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.7■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-201ENST00000509870 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.7■■□□□ 1.87
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHD1O14646 1710 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.69■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.67■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARHGEF11O15085 1522 aa26.65■■□□□ 1.86
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TOP2BQ02880 1626 aa26.61■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNJ2O15056 1496 aa26.6■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.58■■□□□ 1.85
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SYNJ1O43426 1573 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.55■■□□□ 1.84
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PBRM1Q86U86 1689 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ARAP1Q96P48 1450 aa26.39■■□□□ 1.82
HOXC-AS3-201ENST00000509870 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.37■■□□□ 1.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 GRIN2AQ12879 1464 aa26.36■■□□□ 1.81
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ADAMTS12P58397 1594 aa26.33■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-201ENST00000509870 NUP160Q12769 1436 aa26.28■■□□□ 1.8
HOXC-AS3-201ENST00000509870 KIF27Q86VH2 1401 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-201ENST00000509870 CEP170Q5SW79 1584 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-201ENST00000509870 IGF1RP08069 1367 aa26.14■■□□□ 1.78
HOXC-AS3-201ENST00000509870 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 JPH4Q96JJ6 628 aa26.08■■□□□ 1.77
HOXC-AS3-201ENST00000509870 SHROOM2Q13796 1616 aa26.06■■□□□ 1.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.03■■□□□ 1.76
HOXC-AS3-201ENST00000509870 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
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