Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F1

PCDHB12, Protocadherin beta-12, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB12Q9Y5F1 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PCDHB12Q9Y5F1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PCDHB12Q9Y5F1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PCDHB12Q9Y5F1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms