Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCU8

POLD4, DNA polymerase delta subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD4Q9HCU8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
POLD4Q9HCU8 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
POLD4Q9HCU8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms