Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2M9

RAB3GAP2, Rab3 GTPase-activating protein non-catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP2Q9H2M9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
RAB3GAP2Q9H2M9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RAB3GAP2Q9H2M9 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
RAB3GAP2Q9H2M9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
RAB3GAP2Q9H2M9 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms