Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZY7

SCARA3, Scavenger receptor class A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARA3Q6AZY7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCARA3Q6AZY7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARA3Q6AZY7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARA3Q6AZY7 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms