Protein–RNA interactions for Protein: Q14527

HLTF, Helicase-like transcription factor, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLTFQ14527 PRH1-205ENST00000541977 507 ntTSL 214.18□□□□□ -0.146e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 520.64■□□□□ 0.96e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 PLCB1-212ENST00000625874 3206 ntTSL 27.97□□□□□ -1.136e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.312e-6■■■□□ 15
HLTFQ14527 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 516.71■□□□□ 0.262e-6■■■□□ 15
HLTFQ14527 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-6■■■□□ 15
HLTFQ14527 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.053e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-204ENST00000490910 4183 ntTSL 1 (best)12.84□□□□□ -0.354e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-201ENST00000377327 4370 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.754e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-202ENST00000377340 4406 ntTSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.924e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-205ENST00000496549 4093 ntTSL 1 (best)9.17□□□□□ -0.944e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-207ENST00000536226 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.974e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-206ENST00000521379 673 ntTSL 57.38□□□□□ -1.234e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 CRNKL1-203ENST00000490258 733 ntTSL 23.65□□□□□ -1.834e-9■■■□□ 15
HLTFQ14527 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.176e-6■■■□□ 15
HLTFQ14527 DUSP16-202ENST00000298573 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.476e-6■■■□□ 15
HLTFQ14527 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.422e-10■■■□□ 15
HLTFQ14527 CAPRIN2-206ENST00000534897 478 ntTSL 42.72□□□□□ -1.972e-10■■■□□ 15
HLTFQ14527 NASP-208ENST00000470768 1036 ntTSL 314.23□□□□□ -0.134e-14■■■□□ 15
HLTFQ14527 KDM5A-210ENST00000544760 2338 ntTSL 221.74■■□□□ 1.078e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 SERPINA3-201ENST00000393078 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.383e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 SERPINA3-202ENST00000393080 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.413e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 SERPINA3-208ENST00000556968 1289 ntTSL 1 (best)11.03□□□□□ -0.643e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 SERPINA3-206ENST00000555820 981 ntTSL 510.25□□□□□ -0.773e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 AL049839.2-201ENST00000553947 3067 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.863e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 KDM5A-201ENST00000399788 10763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.898e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 SERPINA3-207ENST00000556388 480 ntTSL 48.67□□□□□ -1.023e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 FNIP2-204ENST00000505130 473 ntTSL 35.27□□□□□ -1.573e-13■■■□□ 15
HLTFQ14527 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.177e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 N4BP2-202ENST00000511480 9747 ntTSL 1 (best)4.58□□□□□ -1.687e-7■■■□□ 15
HLTFQ14527 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 04e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ZNF721-203ENST00000506646 935 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.164e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.444e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ZNF721-204ENST00000507078 355 ntTSL 52.84□□□□□ -1.954e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.72e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.632e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KDM4B-206ENST00000588361 3039 ntTSL 216.76■□□□□ 0.272e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KDM4B-208ENST00000589104 3470 ntTSL 214.35□□□□□ -0.112e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KDM4B-209ENST00000592159 411 ntTSL 39.99□□□□□ -0.812e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 RFX7-202ENST00000559847 4165 ntTSL 1 (best)4.58□□□□□ -1.687e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ZNF37BP-202ENST00000452075 8637 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.556e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ABCA11P-203ENST00000507854 1503 ntTSL 1 (best)11.23□□□□□ -0.614e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ABCA11P-201ENST00000451020 1815 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.844e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ZNF721-206ENST00000515578 1679 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.884e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 ABCA11P-204ENST00000514396 1423 ntTSL 1 (best)7.52□□□□□ -1.24e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 RB1CC1-209ENST00000522957 1297 ntTSL 35.08□□□□□ -1.63e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 AGAP1-206ENST00000418654 826 ntTSL 39.16□□□□□ -0.949e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 CDR2-207ENST00000569045 826 ntTSL 516.58■□□□□ 0.241e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 CDR2-203ENST00000563573 556 ntTSL 44.67□□□□□ -1.661e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 216.88■□□□□ 0.293e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.13e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.313e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.343e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.713e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.763e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 METAP2-208ENST00000549808 538 ntTSL 44.27□□□□□ -1.733e-9■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 RALGAPA1-210ENST00000554704 2698 ntTSL 27.53□□□□□ -1.23e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.391e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 MEGF6-205ENST00000485002 4705 ntTSL 517.99■□□□□ 0.471e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.395e-6■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 SCN9A-203ENST00000409672 9768 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.866e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 SCN9A-201ENST00000303354 9786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.986e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.126e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 EIF5B-205ENST00000617677 4698 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.461e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 EIF5B-201ENST00000289371 5777 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.751e-7■■■□□ 14.9
HLTFQ14527 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.721e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 NKTR-201ENST00000232978 7343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.332e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.712e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 NKTR-202ENST00000429888 7325 ntTSL 54.28□□□□□ -1.722e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 DUXAP9-205ENST00000619938 642 ntTSL 1 (best)11□□□□□ -0.651e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 DUXAP9-204ENST00000619210 1060 ntTSL 39.13□□□□□ -0.951e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 DUXAP9-207ENST00000621361 2397 ntTSL 1 (best)6.67□□□□□ -1.341e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.723e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.649e-9■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 KMT2A-201ENST00000389506 13655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.932e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 SKIV2L-204ENST00000465703 4507 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.374e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 ZBED1-205ENST00000515319 905 ntTSL 215.65■□□□□ 0.14e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 C20orf96-203ENST00000400269 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.194e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.234e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 SKIV2L-208ENST00000474839 3378 ntTSL 213.44□□□□□ -0.264e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.334e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 LARS-213ENST00000511505 1089 ntTSL 512.88□□□□□ -0.354e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 SKIV2L-201ENST00000375394 3894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.424e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 C20orf96-201ENST00000360321 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.564e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 LARS-202ENST00000394434 4766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 TNKS-207ENST00000518635 503 ntTSL 510.91□□□□□ -0.664e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 TNKS-208ENST00000519191 496 ntTSL 410.28□□□□□ -0.764e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 THOC2-207ENST00000438358 1137 ntTSL 59.15□□□□□ -0.944e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 KLF3P1-201ENST00000521506 1022 ntBASIC8.3□□□□□ -1.084e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.164e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.32□□□□□ -1.244e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.93□□□□□ -1.35e-13■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.415e-13■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.474e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 CHD9-207ENST00000562806 400 ntTSL 33.71□□□□□ -1.824e-7■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.282e-6■■■□□ 14.8
HLTFQ14527 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.852e-6■■■□□ 14.8
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