RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515319.6

ZBED1-205, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 905 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-205ENST00000515319 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.84■■■■□ 3.97
ZBED1-205ENST00000515319 ABCC9O60706 1549 aa36.95■■■■□ 3.51
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa36.16■■■■□ 3.38
ZBED1-205ENST00000515319 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.35■■■■□ 3.25
ZBED1-205ENST00000515319 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa34.82■■■■□ 3.16
ZBED1-205ENST00000515319 NACADO15069 1562 aa34.36■■■■□ 3.09
ZBED1-205ENST00000515319 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.26■■■■□ 3.08
ZBED1-205ENST00000515319 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.07■■■■□ 3.05
ZBED1-205ENST00000515319 DCAF8L2P0C7V8 631 aa34.06■■■■□ 3.04
ZBED1-205ENST00000515319 BICRAQ9NZM4 1560 aa33.8■■■■□ 3
ZBED1-205ENST00000515319 MYO15BQ96JP2 1530 aa33.56■■■□□ 2.96
ZBED1-205ENST00000515319 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.37■■■□□ 2.93
ZBED1-205ENST00000515319 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.35■■■□□ 2.93
ZBED1-205ENST00000515319 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa33.25■■■□□ 2.91
ZBED1-205ENST00000515319 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.08■■■□□ 2.89
ZBED1-205ENST00000515319 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.05■■■□□ 2.88
ZBED1-205ENST00000515319 SCRIBQ14160 1630 aa32.91■■■□□ 2.86
ZBED1-205ENST00000515319 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.83■■■□□ 2.85
ZBED1-205ENST00000515319 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
ZBED1-205ENST00000515319 CUX2O14529 1486 aa32.17■■■□□ 2.74
ZBED1-205ENST00000515319 ERCC6Q03468 1493 aa31.99■■■□□ 2.71
ZBED1-205ENST00000515319 NCAPD3P42695 1498 aa31.69■■■□□ 2.66
ZBED1-205ENST00000515319 NESP48681 1621 aa31.5■■■□□ 2.63
ZBED1-205ENST00000515319 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa31.5■■■□□ 2.63
ZBED1-205ENST00000515319 HMGXB3Q12766 1538 aa31.4■■■□□ 2.62
ZBED1-205ENST00000515319 SMARCA2P51531 1590 aa31.39■■■□□ 2.61
ZBED1-205ENST00000515319 TRIM41Q8WV44 630 aa31.36■■■□□ 2.61
ZBED1-205ENST00000515319 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.35■■■□□ 2.61
ZBED1-205ENST00000515319 SMARCA4P51532 1647 aa31.28■■■□□ 2.6
ZBED1-205ENST00000515319 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
ZBED1-205ENST00000515319 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.15■■■□□ 2.58
ZBED1-205ENST00000515319 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.12■■■□□ 2.57
ZBED1-205ENST00000515319 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ZBED1-205ENST00000515319 PDS5BQ9NTI5 1447 aa30.99■■■□□ 2.55
ZBED1-205ENST00000515319 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.95■■■□□ 2.54
ZBED1-205ENST00000515319 MRC2Q9UBG0 1479 aa30.78■■■□□ 2.52
ZBED1-205ENST00000515319 WDR62O43379 1518 aa30.73■■■□□ 2.51
ZBED1-205ENST00000515319 CADPSQ9ULU8 1353 aa30.7■■■□□ 2.51
ZBED1-205ENST00000515319 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.69■■■□□ 2.5
ZBED1-205ENST00000515319 OSCARQ8IYS5 282 aa30.57■■■□□ 2.48
ZBED1-205ENST00000515319 CEP164Q9UPV0 1460 aa30.5■■■□□ 2.47
ZBED1-205ENST00000515319 FANCD2Q9BXW9 1451 aa30.38■■■□□ 2.45
ZBED1-205ENST00000515319 WIZO95785 1651 aa30.33■■■□□ 2.45
ZBED1-205ENST00000515319 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
ZBED1-205ENST00000515319 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
ZBED1-205ENST00000515319 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.29■■■□□ 2.44
ZBED1-205ENST00000515319 CFTRP13569 1480 aa30.18■■■□□ 2.42
ZBED1-205ENST00000515319 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
ZBED1-205ENST00000515319 ARHGEF11O15085 1522 aa30.09■■■□□ 2.41
ZBED1-205ENST00000515319 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP29.94■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.93■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319 IFT140Q96RY7 1462 aa29.91■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319 PRDM2Q13029 1718 aa29.91■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319 TRHP20396 242 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
ZBED1-205ENST00000515319 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
ZBED1-205ENST00000515319 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
ZBED1-205ENST00000515319 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.74■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319 CHD1O14646 1710 aa29.74■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319 ARAP1Q96P48 1450 aa29.73■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319 TOPBP1Q92547 1522 aa29.71■■■□□ 2.35
ZBED1-205ENST00000515319 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
ZBED1-205ENST00000515319 FBLN2P98095 1184 aa29.59■■■□□ 2.33
ZBED1-205ENST00000515319 ABCC8Q09428 1581 aa29.59■■■□□ 2.33
ZBED1-205ENST00000515319 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.57■■■□□ 2.32
ZBED1-205ENST00000515319 DNMBPQ6XZF7 1577 aa29.54■■■□□ 2.32
ZBED1-205ENST00000515319 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.52■■■□□ 2.32
ZBED1-205ENST00000515319 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
ZBED1-205ENST00000515319 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
ZBED1-205ENST00000515319 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.31■■■□□ 2.28
ZBED1-205ENST00000515319 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa29.27■■■□□ 2.28
ZBED1-205ENST00000515319 SYNJ1O43426 1573 aa29.26■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa29.25■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.21■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319 SOGA1O94964 1423 aa29.2■■■□□ 2.27
ZBED1-205ENST00000515319 WDR97A6NE52 1622 aa29.16■■■□□ 2.26
ZBED1-205ENST00000515319 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
ZBED1-205ENST00000515319 GAPVD1Q14C86 1478 aa29.08■■■□□ 2.25
ZBED1-205ENST00000515319 FGD5Q6ZNL6 1462 aa29.06■■■□□ 2.24
ZBED1-205ENST00000515319 SYNJ2O15056 1496 aa29.05■■■□□ 2.24
ZBED1-205ENST00000515319 GRIN2BQ13224 1484 aa29.04■■■□□ 2.24
ZBED1-205ENST00000515319 PBRM1Q86U86 1689 aa28.94■■■□□ 2.22
ZBED1-205ENST00000515319 CUX1P39880 1505 aa28.89■■■□□ 2.22
ZBED1-205ENST00000515319 ERCC6L2Q5T890 1561 aa28.8■■■□□ 2.2
ZBED1-205ENST00000515319 KIF13AQ9H1H9 1805 aa28.72■■■□□ 2.19
ZBED1-205ENST00000515319 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa28.72■■■□□ 2.19
ZBED1-205ENST00000515319 CEP170Q5SW79 1584 aa28.69■■■□□ 2.18
ZBED1-205ENST00000515319 GRIN2AQ12879 1464 aa28.67■■■□□ 2.18
ZBED1-205ENST00000515319 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa28.66■■■□□ 2.18
ZBED1-205ENST00000515319 NUP160Q12769 1436 aa28.59■■■□□ 2.17
ZBED1-205ENST00000515319 SHROOM2Q13796 1616 aa28.58■■■□□ 2.17
ZBED1-205ENST00000515319 ADAMTS12P58397 1594 aa28.57■■■□□ 2.16
ZBED1-205ENST00000515319 FAM69CQ0P6D2 419 aa28.44■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319 FHAD1B1AJZ9 1412 aa28.43■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP28.41■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.4■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.4■■■□□ 2.14
ZBED1-205ENST00000515319 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.37■■■□□ 2.13
ZBED1-205ENST00000515319 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 173.4 ms