Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
XRCC4Q13426 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XRCC4Q13426 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XRCC4Q13426 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
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