Protein–RNA interactions for Protein: Q13283

G3BP1, Ras GTPase-activating protein-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
G3BP1Q13283 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.781e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.231e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-202ENST00000426333 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.288e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.598e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.678e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 EFTUD2-220ENST00000591382 3675 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.3□□□□□ -0.928e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 CHD8-213ENST00000557364 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.771e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 CHD8-201ENST00000399982 8229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.841e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.231e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.33e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 PCNA-201ENST00000379143 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-7■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 HSPA4-203ENST00000514825 690 ntTSL 26.26□□□□□ -1.411e-6■■■□□ 17.8
G3BP1Q13283 PAH-208ENST00000549247 961 ntTSL 27.75□□□□□ -1.174e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 COPA-202ENST00000368069 4664 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.133e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 COPA-201ENST00000241704 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.223e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.423e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 MYL12B-202ENST00000400175 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.393e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.763e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.314e-9■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.174e-9■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 515.93■□□□□ 0.144e-9■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 PRMT5-217ENST00000554910 577 ntTSL 412.26□□□□□ -0.451e-6■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 COPG1-203ENST00000504547 586 ntTSL 29.09□□□□□ -0.953e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 323.22■■□□□ 1.315e-10■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 MCM7-211ENST00000491245 648 ntTSL 1 (best)11.24□□□□□ -0.611e-6■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.573e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.063e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 PSMA6-203ENST00000553688 787 ntTSL 59.77□□□□□ -0.856e-9■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 DYNC1H1-201ENST00000360184 14333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.417e-8■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 PSMB6-203ENST00000575079 583 ntTSL 216.88■□□□□ 0.299e-8■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 POLR2B-212ENST00000510355 581 ntTSL 38.77□□□□□ -1.012e-6■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 CCT6A-206ENST00000482776 765 ntTSL 22.38□□□□□ -2.034e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.077e-8■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.657e-8■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.457e-8■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 WDR1-204ENST00000499869 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.217e-8■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 ALDH18A1-202ENST00000371224 3359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 ALDH18A1-201ENST00000371221 3337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-7■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 CCAR2-205ENST00000520738 2633 ntTSL 219.25■□□□□ 0.672e-6■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 PRMT5-220ENST00000556032 643 ntTSL 58.71□□□□□ -1.022e-6■■■□□ 17.7
G3BP1Q13283 IDH1-201ENST00000345146 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.241e-7■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 HECTD1-218ENST00000557695 524 ntTSL 33.76□□□□□ -1.819e-10■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 EIF4G1-230ENST00000460829 1804 ntTSL 224.52■■□□□ 1.525e-9■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 HSPA9-206ENST00000506477 664 ntTSL 220.77■□□□□ 0.923e-7■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 HSPA9-209ENST00000507886 551 ntTSL 311.79□□□□□ -0.523e-7■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PA2G4-207ENST00000553057 687 ntTSL 219.31■□□□□ 0.681e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PA2G4-203ENST00000551061 694 ntTSL 25.15□□□□□ -1.591e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.193e-7■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 KRT8-208ENST00000547031 883 ntTSL 220.19■□□□□ 0.821e-9■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.351e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 NUP188-207ENST00000487952 568 ntTSL 217.44■□□□□ 0.384e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PSMD3-203ENST00000485835 2888 ntTSL 211.96□□□□□ -0.52e-7■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PSMF1-208ENST00000478004 632 ntTSL 214.7□□□□□ -0.068e-10■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PSMF1-205ENST00000381899 704 ntTSL 212.86□□□□□ -0.358e-10■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.172e-7■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 MCM7-209ENST00000485286 2900 ntTSL 220.19■□□□□ 0.821e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.721e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.581e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 MCM7-213ENST00000621318 3084 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -01e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 MCM7-201ENST00000303887 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.091e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 MCM7-210ENST00000489841 2515 ntTSL 1 (best)11.87□□□□□ -0.511e-6■■■□□ 17.6
G3BP1Q13283 ATP5A1-213ENST00000590406 756 ntTSL 324.09■■□□□ 1.451e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.457e-7■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 UNC45A-202ENST00000418476 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.233e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 UNC45A-201ENST00000394275 4002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 UNC45A-216ENST00000639885 3255 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.383e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC23A-208ENST00000555017 588 ntTSL 43.85□□□□□ -1.799e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 LRBA-209ENST00000510413 10032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.991e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 LRBA-201ENST00000357115 9899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.11e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 AHSA1-209ENST00000555729 621 ntTSL 319.63■□□□□ 0.731e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 LRRC41-205ENST00000498402 2068 ntTSL 221.3■■□□□ 16e-8■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 QARS-222ENST00000494838 959 ntTSL 314.52□□□□□ -0.092e-7■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 ADH5-205ENST00000505652 623 ntTSL 58.65□□□□□ -1.021e-7■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-215ENST00000477547 1313 ntTSL 218.97■□□□□ 0.632e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.482e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.262e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.22e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SEC13-216ENST00000479868 2374 ntTSL 1 (best)15.84■□□□□ 0.132e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 HSPA9-212ENST00000523929 780 ntTSL 417.49■□□□□ 0.394e-8■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 GPT2-205ENST00000569193 3205 ntTSL 1 (best)15.56■□□□□ 0.081e-8■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 PSMD2-213ENST00000476461 816 ntTSL 324.14■■□□□ 1.452e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.383e-13■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.113e-13■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.073e-13■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 PSMD2-219ENST00000492191 581 ntTSL 221.27■■□□□ 12e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.943e-13■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.843e-13■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.33e-13■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 CSTF1-208ENST00000613138 562 ntTSL 415.7■□□□□ 0.16e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SETD2-209ENST00000638947 1984 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.166e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 DHX9-207ENST00000485081 2531 ntTSL 213.57□□□□□ -0.241e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 NDUFA9-203ENST00000535050 512 ntTSL 311.3□□□□□ -0.66e-9■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 NUP98-215ENST00000529063 544 ntTSL 37.35□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 17.5
G3BP1Q13283 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.326e-9■■■□□ 17.5
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