Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 HNRNPM-203ENST00000593293 764 ntTSL 34.76□□□□□ -1.659e-8■■■■■ 31.4
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TARDBPQ13148 GATAD2A-210ENST00000457895 729 ntTSL 221.92■■□□□ 1.18e-10■■■■■ 31.4
TARDBPQ13148 AC099489.1-207ENST00000595170 3552 ntTSL 212.35□□□□□ -0.434e-9■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.534e-9■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.155e-7■■■■■ 31.3
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TARDBPQ13148 DNAJB6-207ENST00000441291 614 ntTSL 311.2□□□□□ -0.621e-8■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 SMYD3-205ENST00000453676 562 ntTSL 44.93□□□□□ -1.621e-6■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.154e-9■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.647e-7■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 WDR4-207ENST00000492742 2205 ntTSL 218.89■□□□□ 0.617e-7■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 WDR4-205ENST00000476326 1977 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.177e-7■■■■■ 31.3
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TARDBPQ13148 AC073365.1-204ENST00000439804 901 ntTSL 24.75□□□□□ -1.656e-16■■■■■ 31.3
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TARDBPQ13148 PDXK-207ENST00000438837 342 ntTSL 39.79□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 PUM1-215ENST00000525948 1103 ntTSL 310.75□□□□□ -0.694e-7■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 PUM1-209ENST00000480602 906 ntTSL 58.17□□□□□ -1.14e-7■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 PUM1-218ENST00000526215 586 ntTSL 26.79□□□□□ -1.324e-7■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-9■■■■■ 31.3
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TARDBPQ13148 SUPV3L1-205ENST00000483572 1025 ntTSL 59.33□□□□□ -0.922e-9■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 SUPV3L1-202ENST00000422378 794 ntTSL 58.88□□□□□ -0.992e-9■■■■■ 31.3
TARDBPQ13148 ARPC1B-218ENST00000484375 785 ntTSL 321.92■■□□□ 1.11e-7■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 ARPC1B-207ENST00000431816 581 ntTSL 219.57■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 ARPC1B-205ENST00000427217 545 ntTSL 319.57■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 ARPC1B-203ENST00000417330 559 ntTSL 219.57■□□□□ 0.721e-7■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.381e-7■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CSPP1-202ENST00000519163 3982 ntTSL 23.56□□□□□ -1.847e-9■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 ZNF850-201ENST00000589390 523 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.325e-7■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.55e-7■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.65e-7■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-11■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CTSB-226ENST00000532656 573 ntTSL 417.68■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.381e-6■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CTSB-208ENST00000525076 550 ntTSL 515.63■□□□□ 0.091e-6■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.061e-6■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 CTSB-221ENST00000531502 557 ntTSL 414.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CTSB-231ENST00000534382 764 ntTSL 414.36□□□□□ -0.111e-6■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 MORN1-211ENST00000607342 566 ntTSL 214.15□□□□□ -0.141e-9■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 CTSB-217ENST00000530296 561 ntTSL 413.96□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 31.2
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TARDBPQ13148 CTSB-214ENST00000527243 580 ntTSL 411.06□□□□□ -0.641e-6■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 MORN1-204ENST00000419785 582 ntTSL 310.82□□□□□ -0.681e-9■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 CTSB-205ENST00000505496 540 ntTSL 48.57□□□□□ -1.041e-6■■■■■ 31.2
TARDBPQ13148 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.746e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-208ENST00000420068 505 ntTSL 518.17■□□□□ 0.56e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-203ENST00000382238 1127 ntTSL 314.17□□□□□ -0.146e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.186e-7■■■■■ 31.1
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