Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PITX1P78337 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PITX1P78337 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX1P78337 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX1P78337 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX1P78337 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX1P78337 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PITX1P78337 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX1P78337 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX1P78337 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PITX1P78337 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PITX1P78337 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX1P78337 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PITX1P78337 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PITX1P78337 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX1P78337 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX1P78337 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX1P78337 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PITX1P78337 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PITX1P78337 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PITX1P78337 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PITX1P78337 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms