Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
RAG2P55895 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RAG2P55895 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RAG2P55895 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RAG2P55895 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAG2P55895 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
RAG2P55895 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
RAG2P55895 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
RAG2P55895 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms