Protein–RNA interactions for Protein: P55895

RAG2, V(D)J recombination-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG2P55895 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RAG2P55895 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RAG2P55895 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAG2P55895 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RAG2P55895 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RAG2P55895 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAG2P55895 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAG2P55895 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAG2P55895 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAG2P55895 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RAG2P55895 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RAG2P55895 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RAG2P55895 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RAG2P55895 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
RAG2P55895 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RAG2P55895 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RAG2P55895 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG2P55895 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RAG2P55895 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RAG2P55895 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RAG2P55895 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RAG2P55895 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAG2P55895 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAG2P55895 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAG2P55895 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAG2P55895 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG2P55895 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG2P55895 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RAG2P55895 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RAG2P55895 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG2P55895 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RAG2P55895 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
RAG2P55895 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
RAG2P55895 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAG2P55895 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RAG2P55895 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RAG2P55895 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG2P55895 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RAG2P55895 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RAG2P55895 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RAG2P55895 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RAG2P55895 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RAG2P55895 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAG2P55895 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAG2P55895 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAG2P55895 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAG2P55895 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RAG2P55895 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG2P55895 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RAG2P55895 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RAG2P55895 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RAG2P55895 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG2P55895 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAG2P55895 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAG2P55895 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAG2P55895 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG2P55895 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAG2P55895 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAG2P55895 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG2P55895 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAG2P55895 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG2P55895 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG2P55895 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG2P55895 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG2P55895 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG2P55895 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAG2P55895 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RAG2P55895 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RAG2P55895 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG2P55895 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG2P55895 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAG2P55895 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RAG2P55895 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAG2P55895 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RAG2P55895 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RAG2P55895 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAG2P55895 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG2P55895 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAG2P55895 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAG2P55895 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG2P55895 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG2P55895 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAG2P55895 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAG2P55895 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAG2P55895 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAG2P55895 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAG2P55895 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG2P55895 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG2P55895 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAG2P55895 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG2P55895 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAG2P55895 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG2P55895 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG2P55895 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAG2P55895 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG2P55895 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAG2P55895 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAG2P55895 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAG2P55895 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAG2P55895 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms