Protein–RNA interactions for Protein: P25103

TACR1, Substance-P receptor, humanhuman

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TACR1P25103 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TACR1P25103 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TACR1P25103 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TACR1P25103 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TACR1P25103 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TACR1P25103 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TACR1P25103 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TACR1P25103 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TACR1P25103 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TACR1P25103 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TACR1P25103 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TACR1P25103 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TACR1P25103 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TACR1P25103 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TACR1P25103 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
TACR1P25103 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TACR1P25103 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TACR1P25103 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TACR1P25103 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TACR1P25103 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms