Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CTPS1P17812 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CTPS1P17812 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CTPS1P17812 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms