Protein–RNA interactions for Protein: P08779

KRT16, Keratin, type I cytoskeletal 16, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT16P08779 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT16P08779 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT16P08779 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT16P08779 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT16P08779 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT16P08779 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRT16P08779 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KRT16P08779 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRT16P08779 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KRT16P08779 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT16P08779 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRT16P08779 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRT16P08779 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRT16P08779 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms