Protein–RNA interactions for Protein: P05060

CHGB, Secretogranin-1, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGBP05060 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGBP05060 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CHGBP05060 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGBP05060 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGBP05060 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CHGBP05060 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CHGBP05060 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CHGBP05060 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGBP05060 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGBP05060 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGBP05060 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGBP05060 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGBP05060 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CHGBP05060 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CHGBP05060 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGBP05060 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGBP05060 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CHGBP05060 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGBP05060 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGBP05060 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CHGBP05060 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CHGBP05060 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CHGBP05060 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CHGBP05060 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CHGBP05060 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms