Protein–RNA interactions for Protein: P01034

CST3, Cystatin-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST3P01034 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST3P01034 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST3P01034 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CST3P01034 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST3P01034 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CST3P01034 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST3P01034 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CST3P01034 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST3P01034 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST3P01034 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST3P01034 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CST3P01034 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CST3P01034 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CST3P01034 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CST3P01034 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CST3P01034 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CST3P01034 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CST3P01034 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CST3P01034 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CST3P01034 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CST3P01034 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms