Protein–RNA interactions for Protein: O94898

LRIG2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG2O94898 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRIG2O94898 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRIG2O94898 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms