Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
VAMP4O75379 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
VAMP4O75379 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
VAMP4O75379 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms