Protein–RNA interactions for Protein: O75143

ATG13, Autophagy-related protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG13O75143 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATG13O75143 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ATG13O75143 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ATG13O75143 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG13O75143 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG13O75143 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG13O75143 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG13O75143 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATG13O75143 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
ATG13O75143 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATG13O75143 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATG13O75143 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATG13O75143 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATG13O75143 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATG13O75143 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATG13O75143 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms