Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKNO60260 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKNO60260 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKNO60260 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKNO60260 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PRKNO60260 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PRKNO60260 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PRKNO60260 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PRKNO60260 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PRKNO60260 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKNO60260 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKNO60260 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKNO60260 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PRKNO60260 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PRKNO60260 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PRKNO60260 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PRKNO60260 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PRKNO60260 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKNO60260 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PRKNO60260 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms