Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 THSD4-201ENST00000261862 3133 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 BAIAP3-201ENST00000324385 4678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC004623.1-201ENST00000624592 2127 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 KCNH6-204ENST00000581784 3017 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 LINC00511-213ENST00000581549 2265 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
UBASH3AP57075 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms