Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 LINC00116-203ENST00000611969 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PUS3Q9BZE2 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms