Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LIG1-203ENST00000536218 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PIAS1-202ENST00000545237 2932 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SMARCA4-205ENST00000450717 5506 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TP53INP2-202ENST00000374810 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SLC44A1-202ENST00000374723 9640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 HECTD1-203ENST00000553700 9080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 NAP1L1-201ENST00000261182 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 IKZF1-203ENST00000346667 5376 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 WNT5A-201ENST00000264634 6176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 PHF21B-201ENST00000313237 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 TNRC18P1-201ENST00000502875 3650 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LIPE-201ENST00000244289 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MLX-202ENST00000346833 2334 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 KREMEN1-202ENST00000400335 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATG16L2Q8NAA4 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms