Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
LETM2Q2VYF4 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LETM2Q2VYF4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
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