Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LINC01762-204ENST00000434879 436 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NEDD4L-238ENST00000635997 4402 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MCHR1-201ENST00000249016 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
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