Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FTO-214ENST00000636218 2227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 FUT1-201ENST00000310160 4246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 NRXN1-207ENST00000404971 7578 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SYNPO-205ENST00000522122 5098 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 SLC8A3-205ENST00000394330 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC172P0C7W6 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms