Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 KCNE1-202ENST00000399284 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC004801.1-201ENST00000549557 360 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC142086.5-202ENST00000562500 217 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 HCRTR1-201ENST00000373705 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CACNA1SQ13698 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 CTBP2P6-201ENST00000526402 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CACNA1SQ13698 AC005777.1-201ENST00000588332 187 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
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