Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWI9

RFPL4B, Ret finger protein-like 4B, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL4BQ6ZWI9 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC010536.1-201ENST00000538868 2611 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TUBGCP5-208ENST00000620435 3342 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FOXN3-201ENST00000261302 2542 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SH2D5-201ENST00000375031 3705 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 KRT78-202ENST00000359499 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 SUPT20HL1-201ENST00000436466 2618 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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RFPL4BQ6ZWI9 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 KLC2-206ENST00000417856 3015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FOXN3-219ENST00000615335 2421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
RFPL4BQ6ZWI9 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
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