Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKJ3

CTC1, CST complex subunit CTC1, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTC1Q2NKJ3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 UPK1A-AS1-201ENST00000443196 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CTC1Q2NKJ3 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms