Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GABRB2-205ENST00000517901 1779 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
AP3M2P53677 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms