Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CMPK1-204ENST00000450808 950 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LINC01875-201ENST00000454477 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LINC01398-202ENST00000634819 1292 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AL807740.1-201ENST00000636971 567 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TNNT1-202ENST00000356783 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MYL4-202ENST00000393450 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CBR3-AS1-202ENST00000427491 741 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ARSEP1-202ENST00000430152 499 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PLA2G15-203ENST00000444212 943 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SYN1P17600 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYN1P17600 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYN1P17600 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYN1P17600 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SYN1P17600 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms