Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CLUHP3-207ENST00000563678 1303 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PBDC1-202ENST00000373358 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC092865.2-201ENST00000439409 971 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PLA2G6-213ENST00000447598 567 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC126177.4-201ENST00000547452 731 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 MIR4726-201ENST00000615971 58 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC092115.1-201ENST00000566277 1402 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SFPQP1-201ENST00000446621 1786 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SLIRP-201ENST00000238688 394 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LY6G6F-201ENST00000375832 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LINC00685-201ENST00000391707 428 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC015818.1-201ENST00000451011 244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 LDHAL6CP-201ENST00000502352 1142 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC114939.1-201ENST00000520980 514 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AL136040.1-201ENST00000557775 601 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TTN-AS1-264ENST00000627564 1319 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TCL1A-201ENST00000402399 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 POLR2J2-203ENST00000476151 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 REG3A-201ENST00000305165 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 ABCA1-201ENST00000374733 923 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 C9orf24-202ENST00000379124 648 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AP000281.2-201ENST00000427911 384 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 AC089987.3-201ENST00000551847 588 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 RN7SL460P-201ENST00000582806 258 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FAM208BQ5VWN6 DRD2-204ENST00000538967 1493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms