RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000591501.1

ILF3-AS1-201, humanhuman

BASIC

Gene ILF3-AS1, Length 1,983 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3-AS1-201ENST00000591501 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.54■■■■□ 3.28
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.95■■■□□ 2.55
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.87■■■□□ 2.37
ILF3-AS1-201ENST00000591501 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.41■■■□□ 2.3
ILF3-AS1-201ENST00000591501 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.37■■■□□ 2.29
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ABCC9O60706 1549 aa29.21■■■□□ 2.27
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.11■■■□□ 2.25
ILF3-AS1-201ENST00000591501 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.98■■■□□ 2.23
ILF3-AS1-201ENST00000591501 NACADO15069 1562 aa28.81■■■□□ 2.2
ILF3-AS1-201ENST00000591501 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.56■■■□□ 2.16
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SCRIBQ14160 1630 aa28.5■■■□□ 2.15
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
ILF3-AS1-201ENST00000591501 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.97■■■□□ 2.07
ILF3-AS1-201ENST00000591501 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.65■■■□□ 2.02
ILF3-AS1-201ENST00000591501 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.6■■■□□ 2.01
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.6■■■□□ 2.01
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.57■■■□□ 2
ILF3-AS1-201ENST00000591501 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.46■■□□□ 1.99
ILF3-AS1-201ENST00000591501 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.45■■□□□ 1.99
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SMARCA4P51532 1647 aa27.31■■□□□ 1.96
ILF3-AS1-201ENST00000591501 WIZO95785 1651 aa27.26■■□□□ 1.95
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.94■■□□□ 1.9
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CHIC1Q5VXU3 224 aa26.89■■□□□ 1.89
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SMARCA2P51531 1590 aa26.84■■□□□ 1.89
ILF3-AS1-201ENST00000591501 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.83■■□□□ 1.89
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.82■■□□□ 1.88
ILF3-AS1-201ENST00000591501 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.7■■□□□ 1.86
ILF3-AS1-201ENST00000591501 NCAPD3P42695 1498 aa26.57■■□□□ 1.84
ILF3-AS1-201ENST00000591501 HMGXB3Q12766 1538 aa26.55■■□□□ 1.84
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.42■■□□□ 1.82
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TRIM41Q8WV44 630 aa26.4■■□□□ 1.82
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ABCC8Q09428 1581 aa26.18■■□□□ 1.78
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CFTRP13569 1480 aa26.01■■□□□ 1.75
ILF3-AS1-201ENST00000591501 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26■■□□□ 1.75
ILF3-AS1-201ENST00000591501 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PRDM2Q13029 1718 aa25.92■■□□□ 1.74
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.91■■□□□ 1.74
ILF3-AS1-201ENST00000591501 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SYNJ1O43426 1573 aa25.88■■□□□ 1.73
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TOP2BQ02880 1626 aa25.77■■□□□ 1.72
ILF3-AS1-201ENST00000591501 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.75■■□□□ 1.71
ILF3-AS1-201ENST00000591501 SOGA1O94964 1423 aa25.7■■□□□ 1.71
ILF3-AS1-201ENST00000591501 EEA1Q15075 1411 aa25.7■■□□□ 1.7
ILF3-AS1-201ENST00000591501 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.68■■□□□ 1.7
ILF3-AS1-201ENST00000591501 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.68■■□□□ 1.7
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CUX1P39880 1505 aa25.67■■□□□ 1.7
ILF3-AS1-201ENST00000591501 NESP48681 1621 aa25.65■■□□□ 1.7
ILF3-AS1-201ENST00000591501 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.64■■□□□ 1.7
ILF3-AS1-201ENST00000591501 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.59■■□□□ 1.69
ILF3-AS1-201ENST00000591501 EHMT2Q96KQ7 1210 aa25.57■■□□□ 1.68
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.55■■□□□ 1.68
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.49■■□□□ 1.67
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.48■■□□□ 1.67
ILF3-AS1-201ENST00000591501 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.42■■□□□ 1.66
ILF3-AS1-201ENST00000591501 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.39■■□□□ 1.66
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TOPBP1Q92547 1522 aa25.36■■□□□ 1.65
ILF3-AS1-201ENST00000591501 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.36■■□□□ 1.65
ILF3-AS1-201ENST00000591501 GOLGA3Q08378 1498 aa25.35■■□□□ 1.65
ILF3-AS1-201ENST00000591501 KIF27Q86VH2 1401 aa25.35■■□□□ 1.65
ILF3-AS1-201ENST00000591501 KIF21BO75037 1637 aa25.34■■□□□ 1.65
ILF3-AS1-201ENST00000591501 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.28■■□□□ 1.64
ILF3-AS1-201ENST00000591501 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CUX2O14529 1486 aa25.26■■□□□ 1.63
ILF3-AS1-201ENST00000591501 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
ILF3-AS1-201ENST00000591501 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.18■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.17■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PRXQ9BXM0 1461 aa25.17■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CEP162Q5TB80 1403 aa25.16■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.15■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.15■■□□□ 1.62
ILF3-AS1-201ENST00000591501 IGF1RP08069 1367 aa25.08■■□□□ 1.61
ILF3-AS1-201ENST00000591501 WDR97A6NE52 1622 aa25.06■■□□□ 1.6
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ERCC6Q03468 1493 aa25.06■■□□□ 1.6
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.99■■□□□ 1.59
ILF3-AS1-201ENST00000591501 WDR62O43379 1518 aa24.99■■□□□ 1.59
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CLIP1P30622 1438 aa24.95■■□□□ 1.58
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.94■■□□□ 1.58
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CUL7Q14999 1698 aa24.91■■□□□ 1.58
ILF3-AS1-201ENST00000591501 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.91■■□□□ 1.58
ILF3-AS1-201ENST00000591501 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
ILF3-AS1-201ENST00000591501 IFT140Q96RY7 1462 aa24.85■■□□□ 1.57
ILF3-AS1-201ENST00000591501 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PCGF6Q9BYE7 350 aa24.83■■□□□ 1.57
ILF3-AS1-201ENST00000591501 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PBRM1Q86U86 1689 aa24.77■■□□□ 1.56
ILF3-AS1-201ENST00000591501 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.75■■□□□ 1.55
ILF3-AS1-201ENST00000591501 VPS8Q8N3P4 1428 aa24.73■■□□□ 1.55
ILF3-AS1-201ENST00000591501 GRIN2BQ13224 1484 aa24.7■■□□□ 1.54
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
ILF3-AS1-201ENST00000591501 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
ILF3-AS1-201ENST00000591501 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa24.66■■□□□ 1.54
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ARAP1Q96P48 1450 aa24.66■■□□□ 1.54
ILF3-AS1-201ENST00000591501 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.64■■□□□ 1.54
ILF3-AS1-201ENST00000591501 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.9 ms