RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416636.2

CLK2P1-201, Transcript of CDC like kinase 2, pseudogene 1, humanhuman

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Gene CLK2P1, Length 1,294 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P1-201ENST00000416636 NISCHQ9Y2I1 1504 aa31.04■■■□□ 2.56
CLK2P1-201ENST00000416636 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.81■■■□□ 2.04
CLK2P1-201ENST00000416636 ABCC9O60706 1549 aa27.57■■■□□ 2
CLK2P1-201ENST00000416636 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.35■■□□□ 1.81
CLK2P1-201ENST00000416636 NACADO15069 1562 aa26.22■■□□□ 1.79
CLK2P1-201ENST00000416636 DCAF8L2P0C7V8 631 aa26.04■■□□□ 1.76
CLK2P1-201ENST00000416636 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.93■■□□□ 1.74
CLK2P1-201ENST00000416636 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.86■■□□□ 1.73
CLK2P1-201ENST00000416636 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
CLK2P1-201ENST00000416636 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.71■■□□□ 1.71
CLK2P1-201ENST00000416636 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.7
CLK2P1-201ENST00000416636 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.67■■□□□ 1.7
CLK2P1-201ENST00000416636 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.61■■□□□ 1.69
CLK2P1-201ENST00000416636 SCRIBQ14160 1630 aa25.32■■□□□ 1.64
CLK2P1-201ENST00000416636 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.24■■□□□ 1.63
CLK2P1-201ENST00000416636 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.95■■□□□ 1.58
CLK2P1-201ENST00000416636 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
CLK2P1-201ENST00000416636 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.81■■□□□ 1.56
CLK2P1-201ENST00000416636 SMARCA4P51532 1647 aa24.2■■□□□ 1.46
CLK2P1-201ENST00000416636 NCAPD3P42695 1498 aa24.19■■□□□ 1.46
CLK2P1-201ENST00000416636 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa24.15■■□□□ 1.46
CLK2P1-201ENST00000416636 SMARCA2P51531 1590 aa24.09■■□□□ 1.45
CLK2P1-201ENST00000416636 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
CLK2P1-201ENST00000416636 HMGXB3Q12766 1538 aa24.05■■□□□ 1.44
CLK2P1-201ENST00000416636 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.97■■□□□ 1.43
CLK2P1-201ENST00000416636 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.93■■□□□ 1.42
CLK2P1-201ENST00000416636 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
CLK2P1-201ENST00000416636 NESP48681 1621 aa23.76■■□□□ 1.39
CLK2P1-201ENST00000416636 ERCC6Q03468 1493 aa23.75■■□□□ 1.39
CLK2P1-201ENST00000416636 CUX2O14529 1486 aa23.68■■□□□ 1.38
CLK2P1-201ENST00000416636 WIZO95785 1651 aa23.67■■□□□ 1.38
CLK2P1-201ENST00000416636 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.63■■□□□ 1.37
CLK2P1-201ENST00000416636 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
CLK2P1-201ENST00000416636 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.51■■□□□ 1.35
CLK2P1-201ENST00000416636 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
CLK2P1-201ENST00000416636 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.45■■□□□ 1.34
CLK2P1-201ENST00000416636 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.44■■□□□ 1.34
CLK2P1-201ENST00000416636 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.44■■□□□ 1.34
CLK2P1-201ENST00000416636 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CLK2P1-201ENST00000416636 CFTRP13569 1480 aa23.24■■□□□ 1.31
CLK2P1-201ENST00000416636 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.24■■□□□ 1.31
CLK2P1-201ENST00000416636 WDR62O43379 1518 aa23.21■■□□□ 1.31
CLK2P1-201ENST00000416636 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.19■■□□□ 1.3
CLK2P1-201ENST00000416636 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.18■■□□□ 1.3
CLK2P1-201ENST00000416636 PRDM2Q13029 1718 aa23.11■■□□□ 1.29
CLK2P1-201ENST00000416636 CCDC88BA6NC98 1476 aa23.09■■□□□ 1.29
CLK2P1-201ENST00000416636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CLK2P1-201ENST00000416636 TOPBP1Q92547 1522 aa22.78■■□□□ 1.24
CLK2P1-201ENST00000416636 ABCC8Q09428 1581 aa22.73■■□□□ 1.23
CLK2P1-201ENST00000416636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.72■■□□□ 1.23
CLK2P1-201ENST00000416636 IFT140Q96RY7 1462 aa22.72■■□□□ 1.23
CLK2P1-201ENST00000416636 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
CLK2P1-201ENST00000416636 OSCARQ8IYS5 282 aa22.61■■□□□ 1.21
CLK2P1-201ENST00000416636 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
CLK2P1-201ENST00000416636 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
CLK2P1-201ENST00000416636 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
CLK2P1-201ENST00000416636 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
CLK2P1-201ENST00000416636 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
CLK2P1-201ENST00000416636 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.47■■□□□ 1.19
CLK2P1-201ENST00000416636 CUX1P39880 1505 aa22.47■■□□□ 1.19
CLK2P1-201ENST00000416636 TRIM41Q8WV44 630 aa22.45■■□□□ 1.18
CLK2P1-201ENST00000416636 SOGA1O94964 1423 aa22.44■■□□□ 1.18
CLK2P1-201ENST00000416636 FGD5Q6ZNL6 1462 aa22.44■■□□□ 1.18
CLK2P1-201ENST00000416636 CHD1O14646 1710 aa22.42■■□□□ 1.18
CLK2P1-201ENST00000416636 WDR97A6NE52 1622 aa22.37■■□□□ 1.17
CLK2P1-201ENST00000416636 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
CLK2P1-201ENST00000416636 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
CLK2P1-201ENST00000416636 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
CLK2P1-201ENST00000416636 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.35■■□□□ 1.17
CLK2P1-201ENST00000416636 ARHGEF11O15085 1522 aa22.28■■□□□ 1.16
CLK2P1-201ENST00000416636 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.26■■□□□ 1.15
CLK2P1-201ENST00000416636 FBLN2P98095 1184 aa22.25■■□□□ 1.15
CLK2P1-201ENST00000416636 PBRM1Q86U86 1689 aa22.23■■□□□ 1.15
CLK2P1-201ENST00000416636 GRIN2BQ13224 1484 aa22.22■■□□□ 1.15
CLK2P1-201ENST00000416636 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
CLK2P1-201ENST00000416636 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa22.21■■□□□ 1.15
CLK2P1-201ENST00000416636 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.2■■□□□ 1.14
CLK2P1-201ENST00000416636 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK2P1-201ENST00000416636 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa22.19■■□□□ 1.14
CLK2P1-201ENST00000416636 TOP2BQ02880 1626 aa22.17■■□□□ 1.14
CLK2P1-201ENST00000416636 SYNJ1O43426 1573 aa22.15■■□□□ 1.14
CLK2P1-201ENST00000416636 SYNJ2O15056 1496 aa22.14■■□□□ 1.13
CLK2P1-201ENST00000416636 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
CLK2P1-201ENST00000416636 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.13■■□□□ 1.13
CLK2P1-201ENST00000416636 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CLK2P1-201ENST00000416636 ARAP1Q96P48 1450 aa22.08■■□□□ 1.12
CLK2P1-201ENST00000416636 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.06■■□□□ 1.12
CLK2P1-201ENST00000416636 ADAMTS12P58397 1594 aa21.99■■□□□ 1.11
CLK2P1-201ENST00000416636 GRIN2AQ12879 1464 aa21.96■■□□□ 1.11
CLK2P1-201ENST00000416636 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.94■■□□□ 1.1
CLK2P1-201ENST00000416636 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.9■■□□□ 1.1
CLK2P1-201ENST00000416636 CEP170Q5SW79 1584 aa21.89■■□□□ 1.09
CLK2P1-201ENST00000416636 NUP160Q12769 1436 aa21.88■■□□□ 1.09
CLK2P1-201ENST00000416636 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.8■■□□□ 1.08
CLK2P1-201ENST00000416636 SHROOM2Q13796 1616 aa21.8■■□□□ 1.08
CLK2P1-201ENST00000416636 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CLK2P1-201ENST00000416636 KIF27Q86VH2 1401 aa21.7■■□□□ 1.06
CLK2P1-201ENST00000416636 IGF1RP08069 1367 aa21.68■■□□□ 1.06
CLK2P1-201ENST00000416636 CUL7Q14999 1698 aa21.67■■□□□ 1.06
CLK2P1-201ENST00000416636 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa21.67■■□□□ 1.06
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