Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LEMD1-205ENST00000367154 786 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PPM1L-201ENST00000295839 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LINC01500-204ENST00000556815 752 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDC42EP1Q00587 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms