RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417593.1

RPL17P11-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 11, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P11, Length 544 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P11-201ENST00000417593 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.67■■■■□ 3.3
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RPL17P11-201ENST00000417593 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.62■■■□□ 2.33
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RPL17P11-201ENST00000417593 SMARCA4P51532 1647 aa27.96■■■□□ 2.07
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RPL17P11-201ENST00000417593 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.67■■■□□ 2.02
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RPL17P11-201ENST00000417593 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.38■■□□□ 1.97
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RPL17P11-201ENST00000417593 WIZO95785 1651 aa27.12■■□□□ 1.93
RPL17P11-201ENST00000417593 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.09■■□□□ 1.93
RPL17P11-201ENST00000417593 OSCARQ8IYS5 282 aa27.09■■□□□ 1.93
RPL17P11-201ENST00000417593 CFTRP13569 1480 aa26.98■■□□□ 1.91
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RPL17P11-201ENST00000417593 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.85■■□□□ 1.89
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RPL17P11-201ENST00000417593 TOPBP1Q92547 1522 aa26.51■■□□□ 1.83
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RPL17P11-201ENST00000417593 CHD1O14646 1710 aa26.42■■□□□ 1.82
RPL17P11-201ENST00000417593 ARAP1Q96P48 1450 aa26.4■■□□□ 1.82
RPL17P11-201ENST00000417593 ABCC8Q09428 1581 aa26.4■■□□□ 1.82
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RPL17P11-201ENST00000417593 WDR97A6NE52 1622 aa26.03■■□□□ 1.76
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RPL17P11-201ENST00000417593 CEP170Q5SW79 1584 aa25.56■■□□□ 1.68
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RPL17P11-201ENST00000417593 ADAMTS12P58397 1594 aa25.5■■□□□ 1.67
RPL17P11-201ENST00000417593 SHROOM2Q13796 1616 aa25.5■■□□□ 1.67
RPL17P11-201ENST00000417593 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.49■■□□□ 1.67
RPL17P11-201ENST00000417593 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
RPL17P11-201ENST00000417593 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.38■■□□□ 1.65
RPL17P11-201ENST00000417593 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.38■■□□□ 1.65
RPL17P11-201ENST00000417593 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
RPL17P11-201ENST00000417593 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.3■■□□□ 1.64
RPL17P11-201ENST00000417593 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.3■■□□□ 1.64
RPL17P11-201ENST00000417593 TOP2BQ02880 1626 aa25.28■■□□□ 1.64
RPL17P11-201ENST00000417593 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.26■■□□□ 1.63
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