Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC38A9-202ENST00000396865 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 KHSRPP1-201ENST00000427983 1768 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ERVPABLB-1P60509 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms