Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BEAN1-201ENST00000299694 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ABCD1P33897 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms