Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 GDAP1L1-206ENST00000537864 2855 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ITGA9Q13797 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms