Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 KCNAB2-207ENST00000378111 822 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
RECQLP46063 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 PFN2-206ENST00000461930 606 ntTSL 4 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 GPR61-204ENST00000527748 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
RECQLP46063 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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