Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
EPCAMP16422 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 VIPAS39-208ENST00000556412 1832 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 C17orf62-216ENST00000578919 841 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NME4-203ENST00000397722 1232 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 PSMB8-AS1-204ENST00000429600 996 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SNORD3B-1-201ENST00000577988 758 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
EPCAMP16422 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms