Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TXNDC12-201ENST00000371626 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GNPDA1-204ENST00000503794 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 FAM224A-201ENST00000419557 2031 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TVP23C-CDRT4-203ENST00000522212 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ANKZF1-201ENST00000323348 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RAB39AQ14964 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms