Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 CACNA1C-209ENST00000399603 7377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 NR3C2-203ENST00000358102 5893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 FAIM2-205ENST00000550890 2094 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
FOXD4Q12950 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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FOXD4Q12950 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 SLC35A4-201ENST00000323146 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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FOXD4Q12950 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 ADAMTSL2-201ENST00000354484 4068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CAPN13-201ENST00000295055 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
FOXD4Q12950 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
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