Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
HIRIP3Q9BW71 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZNF239-203ENST00000426961 2027 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RAB6C-201ENST00000410061 3075 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC026992.2-202ENST00000565312 1934 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
HIRIP3Q9BW71 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms