RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.26■■■■□ 3.23
BRMS1-201ENST00000359957 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa31.41■■■□□ 2.62
BRMS1-201ENST00000359957 ABCC9O60706 1549 aa30.67■■■□□ 2.5
BRMS1-201ENST00000359957 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.57■■■□□ 2.32
BRMS1-201ENST00000359957 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.54■■■□□ 2.32
BRMS1-201ENST00000359957 NACADO15069 1562 aa29.52■■■□□ 2.32
BRMS1-201ENST00000359957 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
BRMS1-201ENST00000359957 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.31■■■□□ 2.28
BRMS1-201ENST00000359957 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.18■■■□□ 2.26
BRMS1-201ENST00000359957 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.83■■■□□ 2.21
BRMS1-201ENST00000359957 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.63■■■□□ 2.17
BRMS1-201ENST00000359957 SCRIBQ14160 1630 aa28.63■■■□□ 2.17
BRMS1-201ENST00000359957 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.55■■■□□ 2.16
BRMS1-201ENST00000359957 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.38■■■□□ 2.13
BRMS1-201ENST00000359957 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.01■■■□□ 2.08
BRMS1-201ENST00000359957 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.86■■■□□ 2.05
BRMS1-201ENST00000359957 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.75■■■□□ 2.03
BRMS1-201ENST00000359957 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.57■■■□□ 2
BRMS1-201ENST00000359957 SMARCA4P51532 1647 aa27.38■■□□□ 1.97
BRMS1-201ENST00000359957 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
BRMS1-201ENST00000359957 SMARCA2P51531 1590 aa27.24■■□□□ 1.95
BRMS1-201ENST00000359957 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.2■■□□□ 1.94
BRMS1-201ENST00000359957 NCAPD3P42695 1498 aa27.19■■□□□ 1.94
BRMS1-201ENST00000359957 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.15■■□□□ 1.94
BRMS1-201ENST00000359957 HMGXB3Q12766 1538 aa27.09■■□□□ 1.93
BRMS1-201ENST00000359957 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.09■■□□□ 1.93
BRMS1-201ENST00000359957 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
BRMS1-201ENST00000359957 WIZO95785 1651 aa26.88■■□□□ 1.89
BRMS1-201ENST00000359957 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
BRMS1-201ENST00000359957 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
BRMS1-201ENST00000359957 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.53■■□□□ 1.84
BRMS1-201ENST00000359957 ERCC6Q03468 1493 aa26.52■■□□□ 1.84
BRMS1-201ENST00000359957 NESP48681 1621 aa26.5■■□□□ 1.83
BRMS1-201ENST00000359957 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.41■■□□□ 1.82
BRMS1-201ENST00000359957 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.36■■□□□ 1.81
BRMS1-201ENST00000359957 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.27■■□□□ 1.8
BRMS1-201ENST00000359957 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.25■■□□□ 1.79
BRMS1-201ENST00000359957 CFTRP13569 1480 aa26.24■■□□□ 1.79
BRMS1-201ENST00000359957 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
BRMS1-201ENST00000359957 CUX2O14529 1486 aa26.2■■□□□ 1.78
BRMS1-201ENST00000359957 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
BRMS1-201ENST00000359957 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.13■■□□□ 1.77
BRMS1-201ENST00000359957 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.13■■□□□ 1.77
BRMS1-201ENST00000359957 PRDM2Q13029 1718 aa26.12■■□□□ 1.77
BRMS1-201ENST00000359957 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.06■■□□□ 1.76
BRMS1-201ENST00000359957 WDR62O43379 1518 aa25.96■■□□□ 1.75
BRMS1-201ENST00000359957 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
BRMS1-201ENST00000359957 ABCC8Q09428 1581 aa25.76■■□□□ 1.71
BRMS1-201ENST00000359957 TOPBP1Q92547 1522 aa25.7■■□□□ 1.7
BRMS1-201ENST00000359957 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.69■■□□□ 1.7
BRMS1-201ENST00000359957 IFT140Q96RY7 1462 aa25.56■■□□□ 1.68
BRMS1-201ENST00000359957 CUX1P39880 1505 aa25.47■■□□□ 1.67
BRMS1-201ENST00000359957 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
BRMS1-201ENST00000359957 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.42■■□□□ 1.66
BRMS1-201ENST00000359957 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
BRMS1-201ENST00000359957 SOGA1O94964 1423 aa25.39■■□□□ 1.65
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
BRMS1-201ENST00000359957 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.37■■□□□ 1.65
BRMS1-201ENST00000359957 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.34■■□□□ 1.65
BRMS1-201ENST00000359957 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.34■■□□□ 1.65
BRMS1-201ENST00000359957 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa25.31■■□□□ 1.64
BRMS1-201ENST00000359957 TOP2BQ02880 1626 aa25.3■■□□□ 1.64
BRMS1-201ENST00000359957 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.3■■□□□ 1.64
BRMS1-201ENST00000359957 WDR97A6NE52 1622 aa25.27■■□□□ 1.64
BRMS1-201ENST00000359957 SYNJ1O43426 1573 aa25.26■■□□□ 1.63
BRMS1-201ENST00000359957 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.25■■□□□ 1.631e-6■■■■□ 24.7
BRMS1-201ENST00000359957 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
BRMS1-201ENST00000359957 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.18■■□□□ 1.62
BRMS1-201ENST00000359957 OSCARQ8IYS5 282 aa25.12■■□□□ 1.61
BRMS1-201ENST00000359957 GRIN2BQ13224 1484 aa25.11■■□□□ 1.61
BRMS1-201ENST00000359957 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.11■■□□□ 1.61
BRMS1-201ENST00000359957 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.08■■□□□ 1.6
BRMS1-201ENST00000359957 PBRM1Q86U86 1689 aa25.07■■□□□ 1.6
BRMS1-201ENST00000359957 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-201ENST00000359957 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
BRMS1-201ENST00000359957 FBLN2P98095 1184 aa25.04■■□□□ 1.6
BRMS1-201ENST00000359957 CHD1O14646 1710 aa25.02■■□□□ 1.6
BRMS1-201ENST00000359957 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
BRMS1-201ENST00000359957 SYNJ2O15056 1496 aa24.94■■□□□ 1.58
BRMS1-201ENST00000359957 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.9■■□□□ 1.58
BRMS1-201ENST00000359957 KIF27Q86VH2 1401 aa24.87■■□□□ 1.57
BRMS1-201ENST00000359957 ADAMTS12P58397 1594 aa24.84■■□□□ 1.57
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM41Q8WV44 630 aa24.81■■□□□ 1.56
BRMS1-201ENST00000359957 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.81■■□□□ 1.56
BRMS1-201ENST00000359957 GRIN2AQ12879 1464 aa24.77■■□□□ 1.56
BRMS1-201ENST00000359957 CUL7Q14999 1698 aa24.71■■□□□ 1.55
BRMS1-201ENST00000359957 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.71■■□□□ 1.55
BRMS1-201ENST00000359957 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
BRMS1-201ENST00000359957 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
BRMS1-201ENST00000359957 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.68■■□□□ 1.54
BRMS1-201ENST00000359957 ARHGEF11O15085 1522 aa24.68■■□□□ 1.54
BRMS1-201ENST00000359957 IGF1RP08069 1367 aa24.67■■□□□ 1.54
BRMS1-201ENST00000359957 NUP160Q12769 1436 aa24.63■■□□□ 1.53
BRMS1-201ENST00000359957 CEP170Q5SW79 1584 aa24.62■■□□□ 1.53
BRMS1-201ENST00000359957 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.57■■□□□ 1.52
BRMS1-201ENST00000359957 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.52■■□□□ 1.52
BRMS1-201ENST00000359957 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.46■■□□□ 1.51
BRMS1-201ENST00000359957 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.46■■□□□ 1.51
BRMS1-201ENST00000359957 SHROOM2Q13796 1616 aa24.45■■□□□ 1.5
BRMS1-201ENST00000359957 ARAP1Q96P48 1450 aa24.45■■□□□ 1.5
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