Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY91

SLC5A4, Solute carrier family 5 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A4Q9NY91 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC5A4Q9NY91 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC5A4Q9NY91 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms