Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRAPPC9Q96Q05 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRAPPC9Q96Q05 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRAPPC9Q96Q05 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.2 ms