Protein–RNA interactions for Protein: Q96GY3

LIN37, Protein lin-37 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN37Q96GY3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
LIN37Q96GY3 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
LIN37Q96GY3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIN37Q96GY3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIN37Q96GY3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIN37Q96GY3 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
LIN37Q96GY3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
LIN37Q96GY3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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